近期,浙江大學(xué)在《科學(xué)報告》(Scientific Reports)上在線發(fā)表了題為“Nanoliter-ScaleProtein Crystallization and Screening with a Microfluidic DropletRobot”的論文。該研究利用微流控芯片與機器人技術(shù),將蛋白質(zhì)結(jié)晶反應(yīng)的體積降低至納升甚至皮升級,顯著降低了蛋白質(zhì)的樣品耗樣量,對低表達蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究具有重要意義。
X射線晶體衍射技術(shù)是現(xiàn)階段最主要和最可靠的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定方法,也是當前結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的主要平臺技術(shù)。由于蛋白質(zhì)在結(jié)晶過程中受到蛋白質(zhì)純度、添加劑、沉淀劑種類、離子強度、pH值和溫度等一系列因素的影響,結(jié)晶過程非常復(fù)雜,目前還沒有一個成熟的理論可以成功預(yù)測蛋白質(zhì)的最佳結(jié)晶條件。因此,如何獲得具有足夠衍射分辨率的蛋白質(zhì)晶體成為困擾結(jié)構(gòu)生物學(xué)家的主要問題。
目前,大規(guī)模的結(jié)晶條件篩選仍然是獲得高質(zhì)量的蛋白質(zhì)晶體的主要手段。然而,傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選技術(shù)耗樣量較大,研究成本較高,難以廣泛用于低表達蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,而某些低表達的蛋白質(zhì)往往在生命活動中扮演著極其重要的角色。
目前國際上普遍采用液體處理機器人來進行高通量結(jié)晶篩選,篩選一個結(jié)晶條件的蛋白樣品消耗體積為1-5微升。為了降低單次篩選所需的蛋白質(zhì)樣品體積,工業(yè)界普遍采用微型化的策略來降低最小的液體操縱體積。這當中具有代表性的有英國Douglas公司研制的Oryx-nano系列結(jié)晶機器人、美國ArtRobbins公司研制的Phoenix機器人、英國TTPLabTech公司研制的Mosquito系列機器人等。
采用這些篩選機器人,單個篩選反應(yīng)的蛋白質(zhì)消耗量可降低到50–200nL,比常規(guī)篩選系統(tǒng)降低了20–100倍,不僅顯著地降低了蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選所需的蛋白質(zhì)樣品消耗量,也有效減少了研究成本和時間,因而已成為部分結(jié)構(gòu)生物學(xué)實驗室的標準配置。盡管如此,對于膜蛋白等一些難以表達純化的珍稀蛋白質(zhì)樣品,這類儀器的蛋白質(zhì)耗樣量仍然過高,難以滿足結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的需要。
為了解決這一矛盾,浙江大學(xué)研究團隊發(fā)展了一種基于微流控液滴技術(shù)和自動化機器人技術(shù)的超微量蛋白質(zhì)結(jié)晶和篩選系統(tǒng)。該系統(tǒng)采用順序操作液滴陣列模式構(gòu)建,同時采用微加工技術(shù),在一個1平方厘米的微孔陣列區(qū)域集成了676個獨立的微孔陣列用于高密度的蛋白質(zhì)結(jié)晶孵育和篩選。
通過研究微觀多相流體的特點,結(jié)合系統(tǒng)性裝置優(yōu)化和改進,將液體處理機器人對蛋白質(zhì)和沉淀劑樣品的最小操控體積降低至120皮升,比現(xiàn)有機器人系統(tǒng)降低了約200-800倍。
該裝置被用于對5種水溶性蛋白和1種膜蛋白的大規(guī)模結(jié)晶條件篩選,得到了與常規(guī)篩選體系接近的篩選結(jié)果。單個液滴結(jié)晶反應(yīng)器的體積為4納升,包含2納升的蛋白質(zhì)和2納升的沉淀劑。篩選96種沉淀劑條件,每種條件重復(fù)三次,共生成288個液滴結(jié)晶反應(yīng)器,蛋白質(zhì)溶液的總消耗量僅為579nL,與商品化篩選系統(tǒng)相比,試劑消耗量降低了2-3個數(shù)量級。
由于蛋白質(zhì)消耗量的顯著降低,該裝置還可以用于快速生成蛋白質(zhì)二維結(jié)晶相圖以及研究微觀體系下蛋白質(zhì)結(jié)晶的特殊規(guī)律,為蛋白質(zhì)結(jié)晶的理論研究提供一種有力的工具。
(審核編輯: 小王子)