蛋白質(zhì) ,是大而復(fù)雜的分子,在所有活細(xì)胞中起著至關(guān)重要的作用,是生命活動的執(zhí)行者,它們會自然地構(gòu)建、修飾和分解我們細(xì)胞內(nèi)的其他分子,蛋白質(zhì) 還廣泛用于工業(yè)過程和產(chǎn)品以及我們的日常生活中。
以蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的藥物也非常普遍,例如治療糖尿病的胰島素,就是最常用的處方藥之一,一些昂貴的抗癌藥物也是基于蛋白質(zhì)的抗體藥。
如果想改造出與自然界發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)或酶不同的蛋白質(zhì)和酶, 目前使用的蛋白質(zhì)工程的方法,依賴于將隨機(jī)突變引入蛋白質(zhì)序列, 但是,每引入一個(gè)額外的隨機(jī)突變,蛋白質(zhì)活性就會下降。 而且, 整個(gè)過程非常緩慢,需要進(jìn)行多輪非常昂貴且耗時(shí)的實(shí)驗(yàn),以篩選出數(shù)百萬個(gè)蛋白變體 。
研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種名為 ProteinGAN 的基于AI的生成式深度學(xué)習(xí)方法,該方法能夠 產(chǎn)生 新型的、有功能活性的蛋白質(zhì) ,而且整個(gè)過程非??欤瑑H需幾周時(shí)間就能從計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)到得到有功能活性的蛋白。
這項(xiàng)研究代表了合成蛋白質(zhì)領(lǐng)域的新突破,有助于 更快速、更經(jīng)濟(jì)地開發(fā)基于蛋白質(zhì)的治療藥物 。
研究團(tuán)隊(duì)通過為AI提供大量來自經(jīng)過深入研究的蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),讓AI研究了這些數(shù)據(jù)后,開始嘗試根據(jù)它創(chuàng)建新的蛋白質(zhì)。 同時(shí),AI的另一部分嘗試弄清楚新合成蛋白是否是假的, 蛋白質(zhì)在系統(tǒng)中來回循環(huán),直到AI無法區(qū)分其是天然蛋白質(zhì)還是合成蛋白質(zhì)為止。
實(shí)際上,我們?nèi)粘V泛使用的蛋白質(zhì)并不總是完全天然的,有很多是通過合成生物學(xué)和蛋白質(zhì)工程技術(shù)制成的。使用這些技術(shù),對天然蛋白質(zhì)序列進(jìn)行了修飾,以期創(chuàng)建合成新型蛋白質(zhì)變體,希望這些變體更加有效、穩(wěn)定。
但是傳統(tǒng)方法最大的問題在于效率低下,昂貴且耗時(shí),因此,基于AI的新方法加快對蛋白質(zhì)的改造,能夠大大降低研發(fā)成本,對于開發(fā)基于蛋白質(zhì)的藥物 (例如抗體和疫苗) 以及工業(yè)酶非常重要。
團(tuán)隊(duì)表示,下一步將探索如何將該技術(shù)用于蛋白質(zhì)特性的特定改進(jìn),例如提高穩(wěn)定性,這可能會給工業(yè)技術(shù)、以及疾病治療中使用的蛋白質(zhì)產(chǎn)生極大改進(jìn)和提升。
(審核編輯: monkey)